Sequenciamento de Alto Desempenho

A instalação multiusuária de Sequenciamento de Alto Desempenho é uma unidade dedicada ao sequenciamento em larga escala de ácidos nucleicos (DNA/RNA), possibilitando a realização de estudos para avaliação da expressão gênica de diversos sistemas biológicos, sequenciamento de genomas, metagenomas, metatranscriptomas e marcadores moleculares (16S rDNA e ITS).

Principais competências e técnicas experimentais:

  • Sequenciamento de Metagenomas e Metatranscriptomas de amostras ambientais complexas.
  • Sequenciamento de amplicons, marcadores moleculares como 16S rDNA – Procariotos e ITS – Eucariotos
  • Sequenciamento completo de genomas e transcriptomas (RNA-seq Stranded) de diversos organismos como fungos filamentosos, bactérias, lêveduras e plantas.

Atualmente, a unidade multiusuária é composta por dois sequenciadores que utilizam tecnologia de segunda geração para o sequenciamento em larga escala de ácidos nucleicos, sendo um modelo Miseq e um NextSeq 2000, ambos pertencentes a Plataforma Illumina (Illumina Inc.). A Instalação dispõe de uma equipe altamente qualificada para acompanhamento e assessoramento dos usuários nas atividades laboratoriais, monitorando todas as etapas do processo que vão desde o desing experimental, preparação das amostras até o sequenciamento.

Início de operação: em 2014 e 2015 para usuários externos.

Citação obrigatória a ser utilizada nos trabalhos de usuários

Esta pesquisa utilizou instalações do Laboratório Nacional de Biorrenováveis (LNBR), do Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM), uma Organização Social supervisionada pelo Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (MCTI). A equipe da instalação (NOME DA INSTALAÇÃO) é reconhecida pela assistência durante os experimentos (números das propostas).

Período de uso e submissão

Instalações

Período de submissão 2024

Período de realização 2024

Biofísica de Macromoléculas08/Jan a 29/Nov23/Jan a 13/Dez
Sequenciamento de Alto Desempenho03/Jan a 29/Nov01/Fev a 13/Dez
Metabolômica                              08/Jan a 31/Out08/Jan a 13/Dez
Desenvolvimento e Escalonamento de Bioprocessos                                   REF. A 2024: 22/Nov/23 a 22/Dez/23REF. A 2024: 2024